Po končanem študiju na Medicinski fakulteti v Ljubljani leta 1985 in opravljenem strokovnem izpitu se je najprej zaposlil kot zdravnik splošne prakse v zdravstvenem domu Moste in na nujni medicinski pomoči v Ljubljani, nato pa na Pediatričnem oddelku kirurških strok na Univerzitetnem kliničnem centru v Ljubljani. 

Od leta 1990 je zaposlen na nevrološki kliniki v Ljubljani. Po opravljenem specialističnem izpitu iz nevrologije je leta 1994 prevzel vodenje oddelka intenzivne nevrološke terapije na Univerzitetnem kliničnem centru Ljubljana.

Poleg ukvarjanja s kritično bolnimi nevrološkimi bolniki je njegovo ožje področje preprečevanje in zdravljenje bolnikov z možganskožilnimi boleznimi.

Magister Viktor Švigelj Slovenijo v EU predstavlja tudi kot nacionalni koordinator za trombolizo. Dela pa tudi v zasebni ambulanti.